Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprvP70289 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprvP70289 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PtprvP70289 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PtprvP70289 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PtprvP70289 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PtprvP70289 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprvP70289 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms