Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf6P70279 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf6P70279 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf6P70279 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf6P70279 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf6P70279 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms