Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad54lP70270 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms