Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PrkcbP68404 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms