Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgb1P63158 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms