Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms