Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp46P62069 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp46P62069 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp46P62069 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp46P62069 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp46P62069 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp46P62069 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms