Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ufm1P61961 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ufm1P61961 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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