Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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