Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sem1P60897 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms