Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap25P60879 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap25P60879 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms