Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Paxbp1P58501 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms