Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NcanP55066 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NcanP55066 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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