Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb4P54761 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms