Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Map3k1P53349 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Map3k1P53349 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms