Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SqleP52019 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SqleP52019 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SqleP52019 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SqleP52019 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SqleP52019 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SqleP52019 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SqleP52019 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SqleP52019 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SqleP52019 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SqleP52019 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms