Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfP51642 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntfP51642 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntfP51642 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntfP51642 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntfP51642 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntfP51642 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CntfP51642 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms