Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn1swP51491 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn1swP51491 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms