Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lhx3P50481 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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