Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tmod1P49813 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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