Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psen1P49769 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms