Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms