Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms