Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LmnaP48678 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LmnaP48678 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LmnaP48678 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LmnaP48678 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LmnaP48678 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms