Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtgfrP43117 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms