Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf5P43027 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms