Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms