Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6dP35459 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6dP35459 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6dP35459 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6dP35459 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6dP35459 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6dP35459 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6dP35459 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms