Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptk2P34152 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms