Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms