Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa2P31245 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms