Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BgnP28653 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BgnP28653 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BgnP28653 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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