Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col2a1P28481 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms