Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms