Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjc1P28229 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjc1P28229 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms