Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a1P24549 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms