Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PparaP23204 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PparaP23204 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PparaP23204 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PparaP23204 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms