Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb2P21619 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb2P21619 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms