Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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