Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TP20293 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TP20293 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TP20293 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TP20293 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TP20293 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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