Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P20040 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P20040 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P20040 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P20040 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms