Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NefhP19246 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NefhP19246 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NefhP19246 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NefhP19246 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms