Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnnc1P19123 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms