Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gata1P17679 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms