Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Defa-rs1P17533 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Defa-rs1P17533 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Defa-rs1P17533 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Defa-rs1P17533 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Defa-rs1P17533 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Defa-rs1P17533 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa-rs1P17533 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Defa-rs1P17533 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Defa-rs1P17533 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Defa-rs1P17533 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa-rs1P17533 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa-rs1P17533 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Defa-rs1P17533 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa-rs1P17533 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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