Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RhoP15409 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhoP15409 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhoP15409 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RhoP15409 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhoP15409 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhoP15409 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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