Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Irf1P15314 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf1P15314 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf1P15314 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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