Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms