Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr4a1P12813 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms