Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrm1P12657 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms